Teini-ikäiset mutanttininjakilpikonnat

Tiimi kohtaa mahdollisuuden, että Leonardo ei parane. Uusi mutantti vangitsee Rafaelin.

Donatello ystävystyy Isojalan kanssa metsässä ja vaatii muita suojelemaan sitä metsästäjältä.

Ryhmä löytää haudatun Kraang-laivan ja Aprilin äidin, joka ei ole sitä miltä näyttää.

Kun Michelangelo ystävystyy mutanttisammakon kanssa, hän saa tietää, että sen suku aikoo hyökätä ihmisten kimppuun.

Unia syövät olennot vangitsevat kilpikonnat heidän omiin uniinsa, ja Aprilin ja Caseyn on keksittävä, miten ne herätetään.

Caseyn ja Donnien liitto vaarantuu, kun mutantti terrorisoi teitä.

Aprilin ja Leonardon on pelastettava loput tiimistä uudelta mutantilta.

Leonardo vie kilpikonnat harjoittelemaan kehittynyttä ninjarituaalia, jotta heistä tulisi todellisia ninjoja.

Kilpikonnat palaavat kaupunkiin etsimään Splinteriä, mutta huomaavat, että Kraang on vallannut kaupungin.

Kilpikonnat, Zech ja Steranko etsivät Karaita Kraangdroidien täyttämästä kaupungista.